科学家成功利用基因组的社交网络寻找驱动癌症发生的基因突变

任何1个肿瘤都可能有不计其数个不同的基因突变，但对研究者而言，最大的挑战就是如何寻觅到驱动突变，这些突变通常能够增进癌变效应，有望成为潜伏疗法的新型靶点。

近日，刊登在国际杂志NatureMethods上的研究报告中，来自麻省总医院等机构的研究人员成功利用1种开源计算机工具，通过将癌症基因组数据同蛋白互作数据相结合，成功找到了驱动癌症的近突变，NetSig工具就是研究者所使用的1种补充工具，其能够从当前的分析数据流中有效扩大对癌症基因组的发现。

蛋白互作能够揭露1类基因组脸谱，这是1种能够通过基因同享信息并且携带特殊功能的社交网络，这类额外的功能视角还能帮助研究人员有效鉴别出1些高度可靠的驱动子，特别是很少产生突变的基因。为了开发出NetSig工具，研究人员对来自4742份触及21中癌症类型的肿瘤样本的外显子组数据进行归并整合，随后研究人员在1系列实验中证实了NetSig的能力。

这类新型工具—NetSig具有以下功能：1）能够在所检测的60%的肿瘤类型中辨认出已知的的癌症驱动子，包括那些相对较少的样本；2）能够预测证实实验证明具有促肿瘤效应的新型驱动基因；3）能够在TCGA和其它数据库中鉴别出迄今为止未被注意的驱动基因，特别是，NetSig工具还能够发现，此前被认为致癌基因阴性的肺部肿瘤患者中有4%至14%的患者也许会携带有增进癌症产生的AKT2或TFDP2基因的额外拷贝。

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