乳腺癌细胞的蛋白互作网络或能改变基因的表达情况

近日，1项刊登在国际杂志PLOSComputationalBiology上的研究报告中，来自马里兰大学的研究人员通过研究发现，相比健康细胞而言，1种特定的基因也许在乳腺癌细胞中会表现出不同的功能，而这也许归咎于细胞中相互作用蛋白网络的改变。

此前研究人员发现，单1基因所产生的蛋白能够在细胞中表现出不同的功能，而这依赖于蛋白之间的相互作用；蛋白互作常常会依赖于所处环境而产生改变，比如不同的组织或不同的发育阶段等；举个例子，1种由果蝇关键基因所表达产生的蛋白在果蝇发育的全部进程中也许会发挥两种完全独立的功能。

基于此前研究结果，本文中，研究者SushantPatkar及其同事就假定，乳腺癌细胞中蛋白互作网络的改变也许就会改变单1基因的功能，为了检测这1想法，研究人员对来自1047份乳腺癌肿瘤样本和110份健康乳腺组织样本中的蛋白表达情况进行分析；随后他们开发出了1种计算框架来肯定每种样本中蛋白互作网络的特点，同时推断出究竟是哪一种基因能够介导这些互作网络中不同的细胞功能；另外研究者还将癌细胞和健康细胞中实行每种功能的基因数量进行了对照。

研究结果表明，相比健康细胞而言，癌细胞中的多个功能仿佛和较多或较少的基因表达直接相干，但这其实不是由于这些基因表达所产生的变化，相反，这些功能的改变也许取决于蛋白互作网络的改变；研究者还发现，根据功能转移对病人机体的肿瘤组织进行分析，也许能作为1种有效的方法来预测患者机体癌症亚型和其存活情况。

研究者Patkar说道，对1个基因失去或取得新的生物学功能仿佛是完全可信的，而这类变化的例子主要能够在进化的背景下视察到，因而我们开发出了1种生物信息学方法来对此进行研究，结果发现，诸如这样的改变也许能通过基因编码蛋白互作的改变来产生。下1步研究人员计划通过研究证实是不是这类新型的计算框架能够作为1种工具来帮助评估在其它生物学环境下基因功能的改变，比如其它疾病和组织中。

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